Sumiya Borjigin,Nanako Osawa,Kaixin Li,Yukie Katayama,Yoshio Kawamura,Makoto Haritani,Shinji Makino,Testuya Mizutani,Mami Oba

• A walrus fed with animal formula died in an aquarium in Japan.
• Autopsy revealed multiple necrosis of the liver and adrenal glands.
• Electron microscopy of the liver tissue revealed Herpesvirus-like particles with a tegument structure.
• We named this novel herpesvirus walrus alphaherpesvirus 1 (WaHV-1) based on partial genome sequences from high-throughput sequencing.
• Phylogenetic analysis revealed that WaHV-1 was closely related to Phocid herpesvirus 1 (PhHV-1), which has caused outbreaks in harbor seals.

• 人工乳で育てられた日本の水族館のセイウチが11カ月令で死亡した。剖検により肝臓と副腎の複数の壊死が明らかになった。
• 肝臓組織の電子顕微鏡検査により、ヘルペスウイルスに特徴的なテグメント構造を持つ粒子が確認された。
• 次世代シークエンサーによって明らかにされた部分的なゲノム配列に基づいて、この新しいウイルスはセイウチアルファヘルペスウイルス1（WaHV-1）と名付けられた。
• 系統発生分析により、WaHV-1はゼニガタアザラシでアウトブレイクを引き起こしたアザラシヘルペスウイルス1（PhHV-1）と密接に関連していることが明らかになった。

Wenjing Zhang,Michiyo Kataoka,Yen Hai Doan,Toru Oi,Tetsuya Furuya,Mami Oba,Tetsuya Mizutani,Tomoichiro Oka,Tian-Cheng Li,Makoto Nagai

• A mammalian orthoreovirus (MRV) was firstly identified in a fecal sample of wild boar in Japan.
• This MRV was classified as MRV3; however, shared the L2, L3, and M3, and S2 gene sequence identities with an MRV2 from a lion in a Japanese zoo and a human MRV2, respectively.
• Recombination event was firstly found in the M2 gene.
• This Japanese MRV from wild boar might be generated by reassortment and recombination events between MRVs from several host origin in Japan.

• イノシシから初めてとなる哺乳類オルソレオウイルス(MRV)が日本で分離されました。
• このウイルスはMRV3に分類されましたが、L2、L3およびM3遺伝子は日本の動物園ライオンと、S2遺伝子は日本でヒトから分離されたMRV2と相同性を持っておりました。
• 遺伝子組換えがM2遺伝子に初めて確認されました。
• この我が国のイノシシ由来のMRVは我が国においていくつかの宿主由来のMRVと遺伝子再集合および遺伝子組換えにより生じたと考えられました。

Yuya Sekiguchi, Ayaka Nagata, Fujiko Sunaga, Toru Oi, Ryo Imai, Hiroo Madarame, Yukie Katayama, Mami Oba, Tamaki Okabayashi, Naoaki Misawa, Tomoichiro Oka, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Enterovirus G10 genotype-based recombination (type 1 recombination) with torovirus was firstly discovered in Japanese farm.
• We detected the recombination virus G1, G8, G10, G17 genotypes.
• This recombination events were thought to occur multiple circulating enterovirus G genotypes on the farms.

• エンテロウイルスG10をベースにしたトロウイルスとのタイプ１組換えウイルスを日本の養豚場で発見しました。
• ほかにもエンテロウイルスG1, G8, G17ベースの組換えウイルスも発見しました。
• このウイルス科を越えたゲノムの組換えは様々なエンテロウイルスが養豚場で蔓延していることで発生すると考えられます。

Ayaka Nagata, Yuya Sekiguchi, Toru Oi, Fujiko Sunaga, Hiroo Madarame, Ryo Imai, Kaori Sano, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Mami Oba, Tetsuya Furuya, Junsuke Shirai, Tamaki Okabayashi, Naoaki Misawa, Tomoichiro Oka, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• 37.5% of wild boar fecal samples were entrovirus G (EV-G) positive in Japan.
• 11 samples had a papain-like cysteine protease (PL-CP) sequence, which is called Type 1 recombinant EV-G.
• Type 1 recombinant EV-G was recombinant virus between enterovirus and torovirus.
• This is a first report of discovery of Type 1 recombinant EV-G in wild boars.

• 日本の猪の糞便を調査したところ、37.5%でエンテロウイルスG（EV-G）が検出された。
• このうち、１１サンプルはType 1 recombinant EV-G（EV-Gのゲノムにパパイン様システインプロテアーゼが挿入されている）であった。
• Type 1 recombinant EV-Gはエンテロウイルスとトロウイルスの組み換えウイルスである。
• これまで豚ではType 1 recombinant EV-Gの感染が報告されているが、猪では初めての報告である。

Yuki Fujii, Yuki Kashima, Fujiko Sunaga, Hiroshi Aoki, Ryo Imai, Kaori Sano, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Mami Oba, Tetsuya Furuya, Satoko Tsuzuku, Yoshinao Ouchi, Junsuke Shirai, Tetsuya Mizutani, Tomoichiro Oka, Makoto Nagai

• Complete genome of a porcine torovirus (PToV) strain discovered in Japan was sequenced.
• The PToV composed at least 3 genome backgrounds (US, Chinese and German strains).
• HE coding region exhibits the highest diversity, and the most sequence variation was found in the lectin domain.

• 日本で発見した豚トロウイルスの全ゲノム塩基配列を決定した。
• この豚トロウイルスは少なくとも３つの異なる株（アメリカ、中国、ドイツ株）から構成されていることがわかった。
• HEコーディング領域は最も高い多様性を示し、特にレクチン領域で最も変異が認められた。

Risako Katsuta, Fujiko Sunaga, Toru Oi, Yen Hai Doan, Satoko Tsuzuku, Yoshihisa Suzuki, Kaori Sano, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Mami Oba, Tetsuya Furuya, Yoshinao Ouchi, Junsuke Shirai, Tetsuya Mizutani, Tomoichiro Oka, Makoto Nagai

• We identified Saperovirus (SaV) in fecal samples of wild boars in Japan for the first time.
• We successfully determined complete genome of Group (G) V and GVI of SaV strains
• The GVI SaV was assigned to a new genotype within GVI.
• Wild boar may act as a reservoir for transmission of SaVs to the pig population

• 日本で初めて野生の猪の糞便からサペロウイルスを検出した。
• そして、グループVとVIのサペロウイルスについて全ゲノム塩基配列を決定した。
• グループVIのサペロウイルスは新しい遺伝子型のウイルスである。
• 野生の猪は養豚場へサペロウイルスを伝播するレゼルボアになっているかもしれない。

Fujiko Sunaga, Tsuneyuki Masuda, Hiroshi Aoki, Mika Ito, Kaori Sano, Yuki Naoi, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Mami Oba, Tetsuya Furuya, Junsuke Shirai, Tetsuya Mizutani, Tomoichiro Oka, Makoto Nagai

• Four Sapovirus (SaV) full genome sequences were determined in this study.
• The GX and GXI SaVs genome size were shorten than other SaVs.
• The GX and GXI SaVs evolved from a common ancestor.

• ブタサポウイルスの４株の全ゲノム塩基配列を決定した（GXを２株、GXIを２株）。
• GXとGXI株のゲノムサイズは他のサポウイルスよりも短いことがわかった
• GXとGXI株は共通祖先から分岐してきたと考えられる。

Hiroshi Aoki, Fujiko Sunaga, Hideharu Ochiai, Tsuneyuki Masuda, Mika Ito, Masataka Akagami, Yuki Naoi, Kaori Sano, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Mami Oba, Shoichi Sakaguchi, Tetsuya Furuya, Yoshinao Ouchi, Junsuke Shirai, Tetsuya Mizutani, Tomoichiro Oka, Makoto Nagai

• The 11 posavirus (PsV)-like sequences in porcine feces were identified in this study.
• PsV 8 and 9, PsV-like virus (fisavirus and basavirus) formed invertebrates infecting group.
• PsV except for invertebrates group were classified vertebrates infecting group.

• 本研究ではブタの糞便から得られた11種類のポサウイルス様ウイルスのゲノム配列の決定を行った。
• ポサウイルス8と9およびポサウイルス様ウイルスのフィサウイルスとバサウイルスは無脊椎動物に感染する
• それ以外のポサウイルスは脊椎動物に感染することが明らかになった。

Fujiko Sunaga, Tsuneyuki Masuda, Mika Ito, Masataka Akagami, Yuki Naoi, Kaori Sano, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Mami Oba, Shoichi Sakaguchi, Tetsuya Furuya, Hiroshi Yamasato, Yoshinao Ouchi, Junsuke Shirai, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Genomes of 23 Porcine Sapeloviruses (PSVs) detected in Japanese pigs were analyzed using bioinformatics.
• Secondary structures of the internal ribosome entry site in the 5' untranslated region and a cis-replication element in the 2C coding region were conserved among PSVs.
• Genetic diversity and frequent recombination events were observed among PSVs.

• 本研究では２３種のブタサポウイルスのゲノム解析を実施した。
• 5’非翻訳領域のキャップ非依存性翻訳領域と2C領域のシス複製エレメントはブタサペロウイルスの中で保存されていた。
• ブタサペロウイルスでは遺伝的多様性のあることと頻繁に組換えが起こっていることが明らかになった。

Ryo Imai, Makoto Nagai, Mami Oba, Shoichi Sakaguchi, Makoto Ujike, Ruka Kimura, Moeko Kida, Tsuneyuki Masuda, Moegi Kuroda, Rongduo Wen, Kaixin Li, Yukie Katayama, Yuki Naoi, Shinobu Tsuchiaka, Tsutomu Omatsu, Hiroshi Yamazato, Shinji Makino, Tetsuya Mizutani

• Type 1 recombinant EV-Gs (Enterovirus G) are detected in pig feces in Japan carrying the PLPC (papain-like cysteine protease) gene of torovirus at the junction site of 2C/3A genes.
• In this study, we discovered a novel type 2 recombinant EV-G carrying the PLCP gene with flanking sequences in place of the viral structural genes in pig feces in Japan.
• The phylogenetic analysis suggested that type 1 and 2 recombinant EV-Gs have independently evolved.
• Type 1 recombinant EV-G might have served as a helper virus of type 2 virus.

• これまで我々は豚トロウイルスのPLCP（パパイン様セリンプロテアーゼ）遺伝子が豚エンテロウイルスGのゲノムに組み込まれた1型組換えエンテロウイルスを発見して報告してきた。
• 本研究では、日本の豚農場から構造タンパク質を欠失し、その部分にPLCPなどが挿入された2型組換え豚エンテロウイルスを発見した。
• 系統解析から1型と2型の組換え豚エンテロウイルスは別々に進化してきたことが示唆された。
• 1型組換え豚エンテロウイルスは2型ウイルスのヘルパーウイルスとして機能しているかもしれない。

H Ochiai, K Tamukai, Y Akabane, M Oba, T Omatsu, A Okumura, T Mizutani, H Madarame

• An African pygmy hedgehog adenovirus 1 (AhAdV-1) outbreak in a colony of African pygmy hedgehogs (APHs) with a case of fatal pneumonia occurred in Japan.
• Five viral infected APHs died caused by severe pneumonia and death in one case.
• AhAdV-1 is a novel adenovirus and is suspected to be an emerging pathogen.

• 日本のハリネズミのコロニーでハリネズミアデノウイルス1が致命的な肺炎を起こしたケースを報告した。
• 5匹が重篤な肺炎を呈し、1匹が死亡した。
• ハリネズミアデノウイルス１は新しいアデノウイルスであり新興感染症といえるであろう。

Keita Noguchi, Ryusei Kuwata, Hiroshi Shimoda, Tetsuya Mizutani, Eiichi Hondo, Ken Maeda

• We successfully isolated a novel herpesvirus from the spleen of a greater horseshoe bat (Rhinolophus ferrumequinum) in Japan.
• This herpesvirus was a novel gammaherpesvirus (Rhinolophus gammaherpesvirus 1; RGHV-1).
• 12 of the 84 genes predicted to contain open reading frames did not show any homology to those of other herpesviruses.

• 我々はキクガシラコウモリの脾臓から新しいヘルペスウイルスを分離した。
• このヘルペスウイルスはγヘルペスウイルスに属することがわかった。
• このウイルスの84遺伝子のうち12については既存のヘルペスウイルスとの相同性がなかったことからも、新しいウイルスであることが証明された。

Mami Oba, Yuki Naoi, Mika Ito, Tsuneyuki Masuda, Yukie Katayama, Shoichi Sakaguchi, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Furuya, Hiroshi Yamasato, Fujiko Sunaga, Shinji Makino, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Teschovirus-like viruses were identified in fecal samples from pigs with or without diarrhea.
• They were distantly related to the Teschovirus A in the phylogenetic trees.
• They may represent a novel species in the genus Teschovirus.

• テシオウイルスに類似したウイルスが下痢症または下痢を伴わない豚に糞便から検出されました。
• 系統樹解析では、これらのウイルスはテシオウイルスAと異なっていることが示されました。
• これらのウイルスはテシオウイルス属の中の新しい種である可能性が示されました。

Tsuneyuki Masuda, Fujiko Sunaga, Yuki Naoi, Mika Ito, Hiroki Takagi, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Mami Oba, Shoichi Sakaguchi, Tetsuya Furuya, Hiroshi Yamasato, Junsuke Shirai, Shinji Makino, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• A novel picornavirus, SPPVJ, was identified in pig feces by using a metagenomics approach.
• SPPVJ was organized like a standard picornavirus genome with a type IV IRES.
• SPPVJ was related to bat picornaviruses isolated from bat feces in China.
• SPPVJ were detected in 17.8% (19/107) of the feces from pigs in Japan.

• メタゲノム解析により新しいピコルナウイルスであるSPPVJが豚の糞便中から発見されました。
• SPPVJは基本的なピコルナウイルスの遺伝子構造を有し、タイプIVのIRESを5'日翻訳領域に保有していました。
• SPPVJは中国のコウモリの糞便から検出されたピコルナウイルスに類似していました。
• SPPVJ遺伝子は17.8%(107頭中19頭)の豚の糞便に見いだされ、すでに日本に浸潤していることが示唆されました。

Yoshimasa Hirashima, Daisuke Okada, Shoichi Shibata, Shu Yoshida, Shoichiro Fujisono, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• A neurotropic bovine astrovirus was firstly identified in the brain of a steer showing neurological signs in Japan.
• Based on phylogenetic analisis, this strain belongs to the Virginia/Human-Mink-Ovine clade, which contains most of the neurotropic astroviruses.
• This strain is thought to be generated by intra-genotypic recombination events between American and Europian bovine neurotropic astroviruses.

• 神経親和性を有する牛アストロウイルスが初めて日本で検出されました。
• 系統樹解析で本ウイルスはほとんどの神経親和性アストロウイルス株が属するバージニア/HMOクレードに分類されました。
• 本株は神経親和性牛アストロウイルスアメリカ株とヨーロッパ株との遺伝子相動性組換えにより生じたと考えられました。

Shinobu Tsuchiaka, Yuki Naoi, Ryo Imai, Tsuneyuki Masuda, Mika Ito, Masataka Akagami, Yoshinao Ouchi, Kazuo Ishii, Shoichi Sakaguchi, Tsutomu Omatsu, Yukie Katayama, Mami Oba, Junsuke Shirai, Yuki Satani, Yasuhiro Takashima, Yuji Taniguchi, Masaki Takasu, Hiroo Madarame, Fujiko Sunaga, Hiroshi Aoki, Shinji Makino, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Enterovirus G genomes were detected using metagenomics approach in fecal samples of pigs in Japan.
• These strains were classified into 8 groups (G1, 2, 3, 4, 6, 9, 10, and new) including a novel genotype.
• Interestingly, 17 (16 G1 and one G2) of 59 strains carried a papain-like cysteine protease sequence of porcine torovirus.
• The high prevalence of viruses with a papain-like cysteine protease sequence was firstly reported.

• メタゲノム解析により日本の豚の糞便よりエンテロウイルスG遺伝子が検出されました。
• これらのウイルス株は新しい遺伝子型を含む8つの遺伝子型(G1, 2, 3, 4, 6, 9, 10および新型）に分類されました。
• 59株中17株(G1が16株およびG2が1株)は豚トロウイルスのパパイン様システインプロテアーゼの遺伝子配列をゲノム中に保有していました。
• パパイン様システインプロテアーゼ配列を高率に保有しているエンテロウイルスGが報告されるは今回が初めてです。

Hiroko Ejiri, Chang-Kweng Lim, Haruhiko Isawa, Ryosuke Fujita, Katsunori Murota, Tomomi Sato, Daisuke Kobayashi, Miki Kan, Masashi Hattori, Toshiya Kimura, Yukie Yamaguchi, Mutsuyo Takayama-Ito, Madoka Horiya, Guillermo Posadas-Herrera, Shohei Minami, Ryusei Kuwata, Hiroshi Shimoda, Ken Maeda, Yukie Katayama, Tetsuya Mizutani, Masayuki Saijo, Koki Kaku, Hiroto Shinomiya, Kyoko Sawabe

• We discovered a novel thogotovirus, designated Oz virus (OZV), isolated from the hard tick Amblyomma testudinarium in Japan.
• OZV could replicate in BHK-21 and DH82 cells and caused high mortality in suckling mice after intracerebral inoculation
• Phylogenetic analyses indicated that OZV is most closely related to Bourbon virus, which is a human-pathogenic thogotovirus discovered recently in the United States.

• 我々は日本においてタカサゴキララマダニから新しいトゴトウイルス科のウイルス（Ozウイルスと命名）を発見した。
• Ozウイルスはハムスターなどの細胞で増殖し、マウスに脳内接種すると死亡することがわかった。
• 系統解析からOzウイルスはバーボンウイルス（最近米国で報告されたヒトに病原性のあるトゴトウイルス）に近縁であることが明らかになった。

Hiroko Ejiri, Chang-Kweng Lim, Haruhiko Isawa, Yukie Yamaguchi, Ryosuke Fujita, Mutsuyo Takayama-Ito, Ryusei Kuwata, Daisuke Kobayashi, Madoka Horiya, Guillermo Posadas-Herrera, Itoe Iizuka-Shiota, Satsuki Kakiuchi, Yukie Katayama, Toshihiko Hayashi, Toshinori Sasaki, Mutsuo Kobayashi, Shigeru Morikawa, Ken Maeda, Tetsuya Mizutani, Koki Kaku, Masayuki Saijo, Kyoko Sawabe

• We discovered a novel member of the genus Phlebovirus designated as Kabuto Mountain virus (KAMV), which was isolated from the ixodid tick Haemaphysalis flava in Japan.
• KAMV could infect and replicate in some rodent cell lines and showed pathogenicity in suckling mice.
• This is the first report showing the existence of a previously unrecognized TBPV (tick-borne phleboviruses) in Japan, other than the SFTS (severe fever with thrombocytopenia syndrome) virus.

• 我々は日本においてダニから新しいフレボウイルス（KAMVと命名）を発見した。
• KAMVはげっ歯類の細胞で増殖し、マウスに病原性を示した。
• これは日本においてSFTSV（重症熱性血小板減少症候群ウイルス）以外のダニ媒介性フレボウイルスの存在を示した初めての報告である。

Moegi Kuroda, Tsuneyuki Masuda, Mika Ito, Yuki Naoi, Yen Hai Doan, Kei Haga, Shinobu Tsuchiaka, Mai Kishimoto, Kaori Sano, Tsutomu Omatsu, Yukie Katayama, Mami Oba, Hiroshi Aoki, Toru Ichimaru, Fujiko Sunaga, Itsuro Mukono, Hiroshi Yamasato, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Tomoichiro Oka, Makoto Nagai

• Nearly complete genome sequences of sapovirus from pigs were identified.
• They were classified into seven genogroups.
• Nearly complete genome sequences of GX and GXI represent the first report.
• Possible intergenogroup recombination event was identified.

• サポウイルスのほぼ完全遺伝子配列が豚から検出されました。
• これらは7つの遺伝子型に分類されました。
• 遺伝子型のうち、GXとGXIのほぼ完全遺伝子配列の報告は今回が初めてです。
• 遺伝子組換えの可能性が複数の株で見つかりました。

Masataka Akagami, Mika Ito, Kazutaka Niira, Moegi Kuroda, Tsuneyuki Masuda, Kei Haga, Shinobu Tsuchiaka, Yuki Naoi, Mai Kishimoto, Kaori Sano, Tsutomu Omatsu, Hiroshi Aoki, Yukie Katayama, Mami Oba, Tomoichiro Oka, Toru Ichimaru, Hiroshi Yamasato, Yoshinao Ouchi, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Twenty-four nearly complete genomes of porcine kobuvirus were detected in feces of pigs with or without diarrhea in Japan.
• Japanese porcine kobuviruses shared 85.1-98.3% complete coding nucleotide sequences with porcine kobuviruses from other countries.
• Phylogenetic tree analyses revealed that porcine kobuviruses were not grouped according to their geographical region of origin.
• Similarity plot analysis revealed that multiple recombination events have been contributed to the genetic diversity and evolution of porcine kobuviruses.

• 24株の豚コブウイルス遺伝子を下痢または下痢を伴わない日本の豚の糞便から検出しました。
• 日本の豚コブウイルスは国外株に対して86.1～98.3%の遺伝子全長の相同性が確認されました。
• 系統樹解析の結果、豚コブウイルスは分離された地域と遺伝子の相関性は見出せませんでした。
• 相同性解析の結果、いくつもの遺伝子組換えが発見され、豚コブウイルスの遺伝子多様性と進化に関わっていると考えられました。

Mika Ito, Moegi Kuroda, Tsuneyuki Masuda, Masataka Akagami, Kei Haga, Shinobu Tsuchiaka, Mai Kishimoto, Yuki Naoi, Kaori Sano, Tsutomu Omatsu, Yukie Katayama, Mami Oba, Hiroshi Aoki, Toru Ichimaru, Itsuro Mukono, Yoshinao Ouchi, Hiroshi Yamasato, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Nearly complete genome of Japanese porcine astroviruses were sequenced and analyzed.
• They were classified into four genotypes.
• Multiple possible intra-genotype recombination events were observed.
• Recombination processes may play an important role in the evolution of porcine astroviruses.

• ほぼ完全長の豚アストロウイルス遺伝子を検出し、解析しました。
• これらは4つの遺伝子型に分類されました。
• 複数の種内遺伝子組換えが見つかりました。
• 遺伝子組換えは豚アストロウイルスの進化に重要な役割を果たしていることが示唆されました。

Michiko Hayashi-Miyamoto, Toshiaki Murakami, Fujiko Minami-Fukuda, Shinobu Tsuchiaka, Mai Kishimoto, Kaori Sano, Yuki Naoi, Keigo Asano, Toru Ichimaru, Kei Haga, Tsutomu Omatsu, Yukie Katayama, Mami Oba, Hiroshi Aoki, Junsuke Shirai, Motohiko Ishida, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• VP3, NSP3, and NSP4 of bovine rotavirus B (RVB) were sequenced and analyzed.
• They exhibited high diversity but conserved genetic characteristics of rotaviruses.
• Whole genome analyses revealed that bovine RVBs clustered independently.
• Bovine RVBs likely evolved independently, but similarly to other rotaviruses.

• 牛B群ロタウイルスのVP3、NSP3およびNSP4遺伝子の配列を決定し、解析しました。
• それらは多様性を示しましたが、ロタウイルスに保存されている配列が認められました。
• 全ての遺伝子を解析したところ、牛B群ロタウイルスは独立したクラスターを形成しました。
• 牛B群ロタウイルスは独立しているものの、他のロタウイルスとの相同性を保ちながら進化したと考えられました。

Daisuke Kobayashi, Haruhiko Isawa, Ryosuke Fujita, Katsunori Murota, Kentaro Itokawa, Yukiko Higa, Yukie Katayama, Toshinori Sasaki, Tetsuya Mizutani, Shiroh Iwanaga, Nobuo Ohta, Arlene Garcia-Bertuso, Kyoko Sawabe

• We discovered Armigeres iflavirus (ArIFV), is a novel member of the iflaviruses (genus Iflavirus, family Iflaviridae) from mosquito in the Philippines.
• This is the first successful isolation of iflavirus from a dipteran insect.
• Our findings provide new insights into the infection mechanism, genetic diversity and evolution of the Iflaviridae family.

• 我々はフィリピンの蚊から新規イフラウイルス（ArIFV）を発見した。
• このウイルスは双翅目の昆虫から初めてのイフラウイルスの発見である。
• この論文の知見はイフラウイルスの感染メカニズムや進化についての新しい知見となる。

Satoshi Taniguchi, Ken Maeda, Taisuke Horimoto, Joseph S Masangkay, Roberto Puentespina Jr, James Alvarez, Eduardo Eres, Edison Cosico, Noriyo Nagata, Kazutaka Egawa, Harpal Singh, Aiko Fukuma, Tomoki Yoshikawa, Hideki Tani, Shuetsu Fukushi, Shinobu Tsuchiaka, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Mizutani, Yumi Une, Yasuhiro Yoshikawa, Masayuki Shimojima, Masayuki Saijo, Shigeru Kyuwa

• Pteropine orthoreovirus (PRV)s were isolated from wild bats captured on the Mindanao Islands, The Philippines.
• Phylogenetic analysis indicated that the isolated PRVs were novel strains in which re-assortment events had occurred in the viral genome.
• The Philippine bat-borne PRVs had similar characteristics in terms of antigenicity to those of the Miyazaki-Bali/2007 strain.

• フィリピンで捕獲したコウモリからプテロパインオルソレロウイルスを分離した。
• 系統解析からリアソートメントにより出現した新しいウイルスであることがわかった。
• このフィリピンのウイルスは抗原性の点からバリ島のウイルスと類似の性質を有していることが明らかになった。

Rapeewan Thampaisarn, Vuong N Bui, Dai Q Trinh, Makoto Nagai, Tetsuya Mizutani, Tsutomu Omatsu, Yukie Katayama, Dulyatad Gronsang, Duong H T Le, Haruko Ogawa, Kunitoshi Imai

• A novel serotype of avian paramyxovirus (APMV) was isolated from a duck fecal sample.
• The phylogenetic analysis of the whole genome revealed that the virus was a member of the genus Avulavirus, but that it was distinct from APMV-1 to APMV-13.
• We designated this isolate, as APMV-14/duck/Japan/11OG0352/2011 and propose that it is a novel APMV serotype.

• 新しい血清型の鳥パラミクソウイルス（APMV）をアヒルの糞から分離した。
• 系統解析の結果はパラミクソウイルス科アブラウイルス属に属していたが、どのAPMVからも離れていた。
• そこでこの分離株をAPMV-14/duck/Japan/11OG0352/2011と名付け、APMVの新しい血清型であることを提唱した。

Shinobu Tsuchiaka, Sayed Samim Rahpaya, Konosuke Otomaru, Hiroshi Aoki, Mai Kishimoto, Yuki Naoi, Tsutomu Omatsu, Kaori Sano, Sachiko Okazaki-Terashima, Yukie Katayama, Mami Oba, Makoto Nagai, Tetsuya Mizutani

• Novel bovine enterovirus (BEV) possessing highly divergent aa sequences in the VP1 coding region was discovered in Japan.
• We named this strain as BEV AN12/Bos taurus/JPN/2014 (referred to as BEV-AN12).
• We proposed naming this strain as "Enterovirus K", which is a novel species within genus Enterovirus.

• 日本でVP1領域に新規性のある新しい牛エンテロウイルスを発見した。
• このウイルスをBEV AN12/Bos taurus/JPN/2014と名付けた。
• 我々はこの新規ウイルスをエンテロウイルス属の新しい種として「エンテロウイルスK」と分類されることを提唱したい。

Kaori Sano, Yuki Naoi, Mai Kishimoto, Tsuneyuki Masuda, Hitomi Tanabe, Mika Ito, Kazutaka Niira, Kei Haga, Keigo Asano, Shinobu Tsuchiaka, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Furuya, Yukie Katayama, Mami Oba, Yoshinao Ouchi, Hiroshi Yamasato, Motohiko Ishida, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Metagenome analysis revealed that 11 posavirus-like viruses, which have been reported as new member of the Picornavirales, were found in the feces of pigs in Japan.
• Based on phylogenetic analyses and pairwise amino acid sequence comparison, posavirus-like viruses were subdivided into at least 8 groups and several unassigned sequences.
• It is suggested that at least the proposed 8 genogroups may represent independent genera in the family of posavirus-like virus.

• メタゲノム解析により日本に飼養されている豚の糞便から11株のポサウイルス様ウイルスを検出しました。
• ウイルスアミノ酸配列の系統樹解析および相動性解析からポサウイルス様ウイルスは8つの遺伝子型といくつかの未分類の配列に分類されました。
• 少なくとも8遺伝子型はポサウイルス様ウイルスの中におけるそれぞれ独立した属である可能性が推察されました。

Kazutaka Niira, Mika Ito, Tsuneyuki Masuda, Toshiya Saitou, Tadatsugu Abe, Satoshi Komoto, Mitsuo Sato, Hiroshi Yamasato, Mai Kishimoto, Yuki Naoi, Kaori Sano, Shinobu Tuchiaka, Takashi Okada, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Furuya, Hiroshi Aoki, Yukie Katayama, Mami Oba, Junsuke Shirai, Koki Taniguchi, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Genetic diversity of Japanese porcine rotavirus C was demonstrated.
• Candidate novel genotypes were found in VP7, NSP2, and NSP3.
• Possible evidence of interspecies transmission between porcine and human RVCs was identified.

• 日本の豚C群ロタウイルスの遺伝子多様性を解析しました。
• 新規の遺伝子型の可能性のある遺伝子型の配列がVP7、NSP2およびNSP3において認められました。
• 豚とヒトにおける種間伝播の可能性のあるC群ロタウイルスが検出されました。

Yuki Naoi, Mai Kishimoto, Tsuneyuki Masuda, Mika Ito, Shinobu Tsuchiaka, Kaori Sano, Hiroshi Yamasato, Tsutomu Omatsu, Hiroshi Aoki, Tetsuya Furuya, Yukie Katayama, Mami Oba, Takashi Okada, Junsuke Shirai, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• A novel picornavirus was serendipitously identified in feces of pigs in Japan.
• This virus (porcine picornavirus Japan) had a typical picornavirus genome; however, did not fall into any genera of the family Picornaviridae, suggesting novel genus of Picornaviridae.
• Porcine picornavirus Japan was detected in 23.3 % of the fecal samples from pigs less than four months old,

• 新規のピコルナウイルスが日本の豚におけるメタゲノム解析で発見されました。
• 本ウイルス(SPPVJ)はピコルナウイルスに特有なゲノム構造を有しましたが、既報のピコルナウイルスには分類されず、新規のピコルナウイルスである可能性が示されました。
• SPPVJは日本の4カ月齢以下の豚の23.3%から検出されました。

Asuka Sato, Kentaro Tateishi, Minami Shinohara, Yuki Naoi, Mai Shiokawa, Hiroshi Aoki, Keitaro Ohmori, Tetsuya Mizutani, Junsuke Shirai, Makoto Nagai

• Bovine viral diarrhea 1n and 1o are rare genogroups, which are prevalent only in East Asis including Japan.
• No complete genome sequence data has not been available; therefore, we determined complete genome sequences of Shitara/02/06 and IS26NCP/01.
• Shitara/02/06 (BVDV1n) and IS26NCP/01 (BVDV1o) shared 77.7 to 79.3% and 78.0 to 85.7% sequence identities with other BVDV-1 subgenotype strains, respectively.

• 牛ウイルス性下痢ウイルス1nおよび1oは日本を含めた東アジアに局在する遺伝子型です。
• これまでBVDV1nおよび1oの完全長の遺伝子配列は明らかになっていませんでした。
• Shitara/02/06 (BVDV1n)およびIS26NCP/01 (BVDV1o)は他のBVDV-1型に対して77.7～79.3%の遺伝子相同性を示しました。

Mika Ito, Shinobu Tsuchiaka, Yuki Naoi, Konosuke Otomaru, Mitsuo Sato, Tsuneyuki Masuda, Kei Haga, Tomoichiro Oka, Hiroshi Yamasato, Tsutomu Omatsu, Satoshi Sugimura, Hiroshi Aoki, Tetsuya Furuya, Yukie Katayama, Mami Oba, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Recombination events between porcine and bovine torovirus were identified.
• Recombinant breakpoints were mapped at ORF1b and HE coding regions.
• These recombinant viruses are prevalent throughout Japan.

• 牛トロウイルスおよび豚トロウイルスの遺伝子組換えを発見しました。
• 遺伝子組換えが起こっているのはORF1bおよびHE遺伝子でした。
• この組換えが認められる牛トロウイルスは日本全土に分布すると考えられました。

Konosuke Otomaru, Yuki Naoi, Kei Haga, Tsutomu Omatsu, Takehiko Uto, Motoya Koizumi, Tsuneyuki Masuda, Hiroshi Yamasato, Hikaru Takai, Hiroshi Aoki, Shinobu Tsuchiaka, Kaori Sano, Sachiko Okazaki, Yukie Katayama, Mami Oba, Tetsuya Furuya, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

• Novel kobu-like viruses were identified in feces of cattle in Kagoshima Prefecture, Japan.
• Based on phylogenetic analysis, these viruses were related to kobuviruses; however, clustered except for other kobuviruses.
• These viruses might be novel species of the genus Kobuvirus.

• コブウイルスに類似した新規ウイルスを牛の糞便中から発見しました。
• 系統樹解析では、本ウイルスはコブウイルスに類似しているものの、他のコブウイルスとは異なるグループを形成することがわかりました。
• 本ウイルスはコブウイルス属の新規の種である可能性が示されました。

Ken Komatsu, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Mizutani, Toshiyuki Fukuhara, Motoichiro Kodama, Tsutomu Arie, Tohru Teraoka, Hiromitsu Moriyama

• A novel mycoviral-like dsRNA of approximately 2.5 kbp in length was discovered from phytopathogenic fungus Alternaria spp.
• This dsRNA has a single open reading frame that potentially encodes an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp).
• We named this virus as "Alternaria arborescens mitovirus 1" (AaMV1).

• 植物病原性真菌アルテルナリア属から長さ約2.5kbpの新規マイコウイルス様2本鎖RNAを発見した。
• この2本鎖RNAはRNA依存性RNAポリメラーゼ（RdRp）をコードする単一のオープンリーディングフレームを持っている。
• この新しいウイルスを「Alternariaarborescens mitovirus1」（AaMV1）と名付けた。

Hiromichi Mitake, Yuji Fujii, Makoto Nagai, Naoto Ito, Kota Okadera, Kazuma Okada, Kento Nakagawa, Mai Kishimoto, Tetsuya Mizutani, Katsunori Okazaki, Yoshihiro Sakoda , Ayato Takada, Makoto Sugiyama

• An Ljungan virus (LV) was discovered from fecal samples of wild birds in Japan, and determined the nearly complete sequence of the genome.
• Phylogenetic and similarity analyses based on the VP1 region indicated that the strain constitutes a novel genotype within LV.
• This study provided the first evidence of the presence of a novel LV in Japan.

• 日本の野鳥の糞便からルジャンガンウイルスを発見し、ゲノムのほぼ全長の塩基配列を決定した。
• 系統解析の結果、ルジャンガンウイルスの新しい遺伝子型であることが明らかになった。
• 本研究において日本にもルジャンガンウイルスが存在していることが示された。

Ken Komatsu, Yukie Katayama, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Mizutani, Toshiyuki Fukuhara, Motoichiro Kodama, Tsutomu Arie, Tohru Teraoka Hiromitsu Moriyama

• In this study, we report the molecular characterization of a novel dsRNA mycovirus, Alternaria arborescens victorivirus 1 (AaVV1) from tomato.
• We found that the AaVV1 genome is 5203 bp in length and contains two open reading frames (ORF1 and 2) that overlap at the tetranucleotide AUGA.
• AaVV1 is a member of a distinct species of the genus Victorivirus in the family Totiviridae.

• トマトから新しい2本鎖RNAマイコウイルス、arborescens victorivirus 1 (AaVV1)、を発見した。
• このウイルスゲノムは5203bpのゲノムを持ち、２つのオープンリーディングフレームを持つことが明らかになった。
• AaVV1はトチウイルス科のヴィクトリウイルス属の新種である。

Mami Oba, Tsutomu Omatsu, Ai Takano, Hiromi Fujita, Kozue Sato, Atsushi Nakamoto, Mamoru Takahashi, Nobuhiro Takada, Hiroki Kawabata, Shuji Ando, Tetsuya Mizutani

• A novel bunyavirus was discovered from soft ticks, Argas vespertilionis, in Japan.
• We named this novel virus Soft tick bunyavirus (STBV).
• Phylogenetic analysis showed that segment L of STBV was closely related to a cluster consisting of the genus Nairovirus of the family Bunyaviridae.

• 新しいブニヤウイルスを日本で採取されたマルヒメダニから分離した。
• 我々はこの新規ウイルスをヒメダニブニヤウイルス（STBV）と名付けた。
• 系統解析の結果、STBVのL分節はブニヤウイルス科のナイロウイルス属に属していることが明らかになった。

Makoto Nagai, Tsutomu Omatsu, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Kaku, Graham J Belsham, Kei Haga, Yuki Naoi, Kaori Sano, Moeko Umetsu, Mai Shiokawa, Shinobu Tsuchiaka, Tetsuya Furuya, Sachiko Okazaki, Yukie Katayama, Mami Oba, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani

• Novel viruses were identified in feces from cattle by metagenomics approach.
• These viruses had a standard picornavirus genome organization.
• They are related to unclassified Chinese picornaviruses from bat, cat and dog.
• These viruses were detected in 23% (20/87) feces from cattle in Hokkaido in Japan.　

• メタゲノム解析により牛の糞便から新しいウイルスが発見されました。
• このウイルスは典型的なピコルナウイルスの遺伝子構造を保有していました。
• このウイルスは中国で見つかったコウモリ、猫および犬由来の未分類のピコルナウイルスと類似しておりました。
• このウイルスは23%(20/87頭)の北海道の牛糞便から検出されました。

Makoto Nagai, Tsutomu Omatsu, Hiroshi Aoki, Konosuke Otomaru, Takehiko Uto, Motoya Koizumi, Fujiko Minami-Fukuda, Hikaru Takai, Toshiaki Murakami, Tsuneyuki Masuda, Hiroshi Yamasato, Mai Shiokawa, Shinobu Tsuchiaka, Yuki Naoi, Kaori Sano, Sachiko Okazaki, Yukie Katayama, Mami Oba, Tetsuya Furuya, Junsuke Shirai, Tetsuya Mizutani

• Fifteen nearly complete astrovirus sequences were obtained from Japanese calves.
• Nine strains were clustered with Chinese bovine astroviruses (tentatively named lineage 1) in all phylogenetic trees.
• Three strains clustered with an American strain isolated from cattle with respiratory disease (tentatively named lineage 2).
• Two strains clustered with lineage 1 in the open reading frame (ORF)1a and ORF1b regions, while they clustered with lineage 2 in the ORF2 region, suggesting recombination events.
• One strain clustered with porcine astrovirus type 5 in all trees, and ovine astrovirus in the ORF2 region, suggesting past interspecies transmission.

• 15株のほぼ完全長のアストロウイルス遺伝子が日本の子牛から検出されました。
• そのうち9株は中国の牛アストロウイルスとともにクラスターを形成し、系統1と名付けました。
• 3株は米国で呼吸器病を示す牛から検出された株とともにクラスターを形成し、系統2と命名しました。
• 2株はオープンリーディングフレーム(PRF)1aおよび1bは系統1にORF2は系統2に相同性示し、遺伝子組換えが起こっている可能性が示されました。
• 1株は遺伝子全長にわたり豚アストロウイルス5と、ORF2はめん羊由来株と類似性を示したことから、種間伝播したウイルスであることが示唆されました。

Makoto Nagai, Saya Shimada, Yoshiki Fujii, Hiromitsu Moriyama, Mami Oba, Yukie Katayama, Shinobu Tsuchiaka, Sachiko Okazaki, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Furuya, Satoshi Koyama, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani

• This report presents the first case of H2 NSP5 genotype in porcine rotavirus.
• These porcine rotavirus strains showed super-short RNA patterns.
• These strains were detected from healthy piglets or piglets with diarrhea.
• Intra-genotype reassortments among porcine and human rotaviruses were observed.
• The possibility of interspecies transmission between pigs and humans was suggested.

• NSP5の遺伝子型がH2の豚ロタウイルスを世界で初めて発見しました。
• この豚ロタウイルスは稀であるスーパーショートRNA泳動パターンを示しました。
• このウイルスは健康な豚と下痢を呈する豚の両方から検出されました。
• ゲノムの由来から、このウイルスはヒトロタウイルスと豚ロタウイルスの遺伝子再集合により生じたと考えられました。
• これらのことから、豚とヒトとで種間伝播が起こった可能性が示されました。

Kouji Sakai, Katsuro Hagiwara, Tsutomu Omatsu, Chinami Hamasaki, Ryusei Kuwata, Hiroshi Shimoda, Kazuo Suzuki, Daiji Endoh, Noriyo Nagata, Makoto Nagai, Yukie Katayama, Mami Oba, Ichiro Kurane, Masayuki Saijo, Shigeru Morikawa, Tetsuya Mizutani, Ken Maeda

• A novel rhabdovirus, wild boar rhabdovirus 1 (WBRV1), was isolated from the serum of a healthy Japanese wild boar.
• WBRV1 is closely related to Tupaia rhabdovirus (TRV) belonging to a new genus of Rhabdoviridae.
• 6.5% of wild boars in Wakayama prefecture in Japan were positive for the WBRV1 gene and 52% were positive for WBRV1-neutralizing antibodies.

• 新しいラブドウイルス、イノシシラブドウイルス１（WBRV1）を日本の健康なイノシシから発見した。
• WBRV1はツパイラブドウイルスと近縁で、ラブドウイルス科の新しい属を形成する。
• 和歌山県の野生イノシシの6.5%でPCR陽性、52%で中和抗体陽性であり野生動物に浸潤していることが明らかになった。

Kaori Sano, Sachiko Okazaki, Satoshi Taniguchi, Joseph S Masangkay, Roberto Puentespina Jr, Eduardo Eres, Edison Cosico, Ni?a Quibod, Taisuke Kondo, Hiroshi Shimoda, Yuuki Hatta, Shumpei Mitomo, Mami Oba, Yukie Katayama, Yukiko Sassa, Tetsuya Furuya, Makoto Nagai, Yumi Une, Ken Maeda, Shigeru Kyuwa, Yasuhiro Yoshikawa, Hiroomi Akashi, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Mizutani

• A novel gammaherpesvirus was discovered from bats in the Philippines.
• The infection rate among the captured bats by PCR was 30 %.

• フィリピンのコウモリから新規ガンマヘルペスウイルスを発見した。
• PCRによる感染率は約30％であった。

Satoshi Koyama, Syun-Ichi Urayama, Tsutomu Ohmatsu, Yukiko Sassa, Chihiro Sakai, Mamoru Takata, Shinya Hayashi, Makoto Nagai, Tetsuya Furuya, Hiromitsu Moriyama, Toshiyuki Satoh, Shin-Ichi Ono, Testuya Mizutani

• A novel dsRNA virus, Camponotus yamaokai virus, was identified from the arboreal ant Camponotus yamaokai.
• Phylogenetic analyses revealed that the virus was most likely a novel totivirus.
• The virus was detected by PCR in all caste members and developmental stages of ants.

• 樹上性の蟻から新しい2本鎖RNAウイルス、ヤマヨツボシオオアリウイルス、を発見した。
• 系統解の結果、トチウイルスに属する新しいウイルスであることが明らかになった。
• このウイルスはアリのすべてのカーストと発育ステージで検出された。

Makoto Nagai, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Takashi Kozasa, Kaho Tominaga-Teshima, Junki Mine, Yuri Abe, Tomokazu Tamura, Tsubasa Kobayashi, Kaoru Nishine, Kentaro Tateishi, Yudai Suzuki, Mai Fukuhara, Keitaro Ohmori, Reiko Todaka, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Shigeyuki Nakamura, Hiroshi Kida, Junsuke Shirai

• Border disease virus was firstly identified in pigs in Japan.
• Phylogenetic analysis revealed that this virus was clustered into BDV genotype 1 with ovine strains.
• This strain grew in porcine, bovine, and ovine primary cells and cell lines, but grew better in bovine and ovine cells than in porcine cells.
• Specific pathogen-free pigs inoculated with FNK2012-1 did not show any clinical signs.
• This strain may be of ruminant origin and is poorly adapted to pigs.

• 日本で初めてボーダー病ウイルスが豚から検出されました。
• 系統樹解析により、このウイルスはボーダー病ウイルス1型に分類されることがわかりました。
• 本ウイルスは豚、牛およびめん羊の細胞で増殖することがわかりましたが、豚よりも牛およびめん羊の細胞の方でより増殖することが確認されました。
• SPF豚への接種では症状は全く確認されませんでした。
• 本ウイルスは反芻獣由来であり、豚にはまだ馴化していないと考えられました。

Tsuneyuki Masuda, Makoto Nagai, Hiroshi Yamasato, Shinobu Tsuchiaka, Sachiko Okazaki, Yukie Katayama, Mami Oba, Naomi Nishiura, Yukiko Sassa, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Furuya, Satoshi Koyama, Junsuke Shirai, Koki Taniguchi, Yoshiki Fujii, Reiko Todaka, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani

• A group A rotavirus (GAR) was isolated from an outbreak of diarrhea and milk drop in cows in 2013, Japan.
• This GAR, named Tottori-SG, exhibited yet not reported genotype combination, G15-P[14]-I2-R2-C2-M2-A3-N2-T6-E2-H3 representing VP7-VP4-VP6-VP1-VP2-VP3-NSP1-NSP2-NSP3-NSP4-NSP5, respectively.
• Whole genome analyses suggested that this novel GAR might be derived from multiple reassortment events from group A rotavirus strains circulating among Japanese cattle.

• 2013年に我が国でA群ロタウイルス(GAR)による乳量減少を伴う成牛の下痢症が発生しました。
• このGARは未だ報告のないG15-P[14]-I2-R2-C2-M2-A3-N2-T6-E2-H3（VP7-VP4-VP6-VP1-VP2-VP3-NSP1-NSP2-NSP3-NSP4-NSP5に対応）という遺伝子型の組み合わせを示しました。
• 全ゲノム解析の結果、この新規GARは我が国の牛群内で流行しているGAR株の遺伝子再集合により生じたと考えられました。